Kurzusleírás

Bevezetés a Fiji és az ImageJ-be

  • Áttekintés a Fiji-ről és annak alkalmazásairól a tudományos kutatásban
  • Az ImageJ architektúrájának és beépülő modulainak megismerése
  • A Fiji telepítése és optimalizálása a legjobb teljesítmény érdekében

Alapvető képfeldolgozási technikák

  • Képregisztráció és import formátumok
  • Kontraszt, fényerő és szűrők alkalmazásának beállítása
  • Képveremelési és projekciós módszerek

Haladó képfeldolgozás

  • Szegmentation technikák: küszöbérték beállítása és szélenesítés
  • Objektumok számolása és részecskének analízise histológiai mintákon
  • Területek, keretek és más morfológiai jellemzők mérése

Munka a biológiai mintákkal

  • Histológiai tükörkönyvek, vércsomók és algák képfeldolgozása
  • Szín felosztás és stain minták analízise
  • Időtartam alapú analízis és sejtmegmozgáskövetés

Automatizálás és testreszabás

  • Makrok létrehozása és futtatása ismétlődő feladatok esetén
  • A Fiji beépülő modulainak használata a specializált analízishez
  • Alapvető szkriptek írása az ImageJ Makro Nyelv (IJM) segítségével

Adatkezelés és jelentéskészítés

  • Eredmények exportálása és jelentések készítése
  • Képek feliratolása és adatok publikációra való előkészítése
  • A reprodukálható képfeldolgozás jós gyakorlatai

Összefoglalás és a következő lépések

Követelmények

  • Alapvető ismeretek a biológiai képfeldolgozási koncepciókról
  • Ismeret az elektronmikroszkópiáról és histológiai technikákról
  • Alapvető számítógépes ismeretek

Célcsoport

  • Kutatók a biotechnológiában és környezeti toxikológiaban
  • Laborprofesionálisok, akik histológiai és sejtképfeldolgozással dolgoznak
  • A mennyiségi képfeldolgozáshoz érdeklődő tudósok
 14 Órák

Résztvevők száma


Ár résztvevőnként

Közelgő kurzusok

Rokon kategóriák